Основні наукові підрозділи
Самостійні наукові підрозділи
- Інститут прикладної економіки та бухгалтерського обліку залізничного транспорту
- Науково-дослідний центр проблем управління на залізничному транспорті
- Науково-освітній центр інноваційного розвитку пасажирських залізничних перевезень
- Науково-дослідна лабораторія «Магнітоелектричні транспортні системи»
- Науково-дослідна лабораторія «Інноваційний розвиток транспорту»
- Науково-дослідна лабораторія «Інфраструктура магнітолевітаціонного транспорту»
- Науково-освітній центр «Промисловий і міський транспорт»
- Випробувальний центр «Промисловий і міський транспорт»
- Випробувальний центр «Екологічна безпека та охорона праці»
- Випробувальна лабораторія «Механічна лабораторія ім. проф. Н.А. Белелюбського »
Наукові підрозділи в складі кафедр
- Науково-дослідна лабораторія «Динаміка вагонів»
- Лабораторія неруйнівного контролю та діагностики підйомних споруд
- Кваліфікаційний центр з неруйнівного контролю
- Науково-дослідна лабораторія «Очищення і знезараження природних, промислових стічних вод, систем вентиляції і кондиціонування»
- Галузева науково-дослідна лабораторія стрілочного господарства
- Науково-дослідна і випробувальна лабораторія «Інженерно-геологічні вишукування при проектуванні транспортних об'єктів»
- Науково-дослідна лабораторія «Комплексний розвиток транспортних систем»
- Науково-дослідна лабораторія програмних засобів неруйнівного контролю
- Науково-дослідний технічний центр «Сократ»
- Випробувальний центр «Міцність-серт»
- Випробувальний центр «Міцність»
- Науково-дослідна лабораторія «Будівельні матеріали, вироби і конструкції»
- Наукова випробувальна лабораторія «Мостова лабораторія»
- Випробувальна лабораторія «Грунти та будівельні матеріали»
- Випробувальна лабораторія засобів захисту інформації за вимогами безпеки інформації
- Центр будівельних та інвестиційних проектів
- Науково-освітній центр «Мультимодальні транспортні системи»
- Науково-освітній центр «Автоакадемия»
- Центр інноваційного розвитку електричного рухомого складу
- Науково-дослідна лабораторія «Автоматизація проектування і моделювання систем ЖАТ»
- Галузева науково-дослідна лабораторія «Автоматизація технічного обслуговування, діагностика і моніторинг систем ЖАТ»
- Центр комп'ютерних залізничних технологій
- випробувальний центр
- Лабораторія «Навчання і впровадження комп'ютерних залізничних технологій»
- Лабораторія «Електромагнітною сумісності і електроживлячих пристроїв залізничної автоматики»
- Науково-дослідна лабораторія «Функціональної діагностики»
- Випробувальна лабораторія програмних засобів залізничного транспорту
Малі інноваційні підприємства
- Науково-інноваційний центр «Вагони»
- Науково-інноваційний центр «Вагон-Тест»