Особливе місце в розвитку Санкт-Петербурга належить сфері освіти. Вона охоплює такі напрямки діяльності: загальна освіта (дошкільні та загальноосвітні установи), професійну освіту (установи, що реалізують програми середньої та вищої професійної освіти), а також установи додаткової освіти дітей і дорослих і додаткової професійної освіти, в т.ч. програми перепідготовки кадрів. В управлінні розвитком сфери освіти Санкт-Петербурга використовується комплексний підхід, що враховує відмінності відомчої належності та форм власності установ.
Система професійної освіти забезпечує навчання і соціалізацію понад 450 тис. Студентів і є однією з найбільших галузей економіки в Санкт-Петербурзі з 80 тис. Працівників і загальним щорічним обсягом фінансування понад 50 млрд руб. У сфері професійної освіти існують диспропорції між потребами економіки міста і структурою випуску закладів професійної освіти. Популярність гуманітарних напрямів навчання у студентів не узгоджується з реально існуючими потребами господарського комплексу в підготовлених кадрах з технічних і інженерних спеціальностей. За експертними оцінками, одноразова потреба ринку праці Санкт-Петербурга в додаткових кадрах в середньостроковій перспективі буде становити 75-90 тис. Чол. з них близько двох третин - фахівці з початковим і середньою професійною освітою.
До числа інших проблем, що існують в сфері освіти Санкт-Петербурга, відносяться:
- невідповідність розвитку мережі установ загальної освіти (в першу чергу дошкільного) тенденціям демографічного і територіального розвитку;
- недостатня ефективність механізмів підвищення кваліфікації, перепідготовки, стимулювання і залучення висококваліфікованих і молодих фахівців;
- недостатній розвиток систем професійної та громадської експертизи освітньої діяльності, низький рівень впровадження процедур оцінки освітніх установ;
- довгострокова тенденція зниження привабливості навчання у закладах початкової та середньої професійної освіти;
- відсутність підвідомчих місту установ вищої і додаткової професійної освіти, які здійснюють підвищення кваліфікації і перепідготовку фахівців для пріоритетних галузей економіки Санкт-Петербурга;
- низька привабливість установ освіти Санкт-Петербурга для іноземних студентів і провідних світових педагогів і вчених, недостатній рівень розвитку дослідницької та наукової діяльності при ВУЗах.
У ряді районів Санкт-Петербурга спостерігається нестача закладів охорони здоров'я амбулаторної мережі. Дана проблема пов'язана з активним житловим будівництвом в північних і південно-західних районах (Виборзький, Приморський, Красносельський, Пушкінський). Недолік поліклінік компенсується відкриттям відділень загальнолікарської практики. На одного лікаря припадає 1,7 представників середнього медичного персоналу при нормативі 1: 3. Укомплектованість відділень медичної реабілітації лікарями фізіотерапевтами становить 74%. Число молодшого медичного персоналу по догляду за хворими в 2 рази менше кількості штатних посад.
До числа ключових проблем розвитку сфери культури Санкт-Петербурга відносяться:
- недостатня доступність культурних благ і невідповідність їх пропозиції попиту з боку жителів і гостей міста;
- забезпеченість міста основними типами закладів культури відстає від федеральних нормативів;
- труднощі з належним збереженням об'єктів культурної спадщини;
- низька культурна активність значної частини населення.
Незважаючи на досягнуті успіхи, залучення населення до занять фізичною культурою і спортом є недостатнім. Багато об'єктів спортивної інфраструктури вимагають капітального ремонту і оснащення спортивним інвентарем, не вистачає кваліфікованих кадрів. Практично відсутні можливості для заняття фізичною культурою для осіб з обмеженими можливостями здоров'я. З цілої низки видів спорту, в т.ч. олімпійських, фіксується відсутність матеріальної бази (вітрильний, водномоторний, гребний, керлінг і ін.).
Накопичено значний досвід роботи з дітьми та молоддю за місцем проживання. Функціонують 325 підліткових молодіжних клубів, які щомісяця відвідують понад 38% підлітків, які перебувають на обліку в підрозділах у справах неповнолітніх. У районах Санкт-Петербурга працюють 10 будинків молоді. З метою недопущення розповсюдження наркотиків здійснюється первинна профілактика наркозалежних серед підлітків і молоді Санкт-Петербурга.
До числа найбільш складних проблем, що діють в молодіжному середовищі та перешкоджають процесам інтеграції молоді в сучасне суспільство, відносяться:
- низький рівень доступності житла (власного або орендованого) для молодих сімей;
- наявність молодіжного безробіття;
- поширення наркоманії та алкоголізму в молодіжному середовищі;
- низький рівень інформованості молоді про можливості самореалізації;
- патріотизм значної частини молоді носить утилітарний і поверхневий характер;
- отримані молоддю навички участі в програмах міжнародного обміну часто залишаються незатребуваними в проектах, що реалізуються в Санкт-Петербурзі.
Однак міграція в Санкт-Петербург має більш істотні масштаби, ніж це враховується державною статистикою. Значна частина гостей прибуває в Санкт-Петербург з трудовими цілями, отримує реєстрацію на термін менше 9 місяців і не враховується в якості постійного населення. Більшу частину трудових мігрантів, які прибувають в Санкт-Петербург, складають громадяни, які претендують на зайняття вакансій, які не потребують доброго знання російської мови, високою або середньої кваліфікації. Збільшення припливу мігрантів призводить до серйозних негативних наслідків: зростання ксенофобії серед корінного населення, виникненню міжнаціональної та міжконфесійної напруженості, погіршення криміногенної ситуації, зниження стимулів до автоматизації виробничих процесів.