Будова системи органів розмноження у самок птахів має деяку особливість. У більшості самок тварин яєчники парні, з кожного боку до них підходять яйцеводи, що впадають в матку. У більшості птахів правий яєчник і яйцепровід повністю редукуються, хоча в період ембріонального розвитку закладаються два яєчника і два яйцевода.
У неактивному стані система органів розмноження включає крихітний, з горошину, яєчник і тонку трубочку, яка в подальшому переходить в яйцепровід, матку (скорлуповую залозу) і піхву.
Коли самка готова до виробництва яєць, всі частини статевої системи значно збільшуються в розмірах. Яєчник займає практично всю черевну порожнину. Що достигають фолікули висять на яєчнику, як ягоди на виноградній лозі. Фолікули в яєчнику «дозрівають», перетворюючись в яйцеклітини, знайомі нам ка жовток. Яйце, багате жовтком, вивільняється яичником і потрапляє в відкриту «воронку» яйцевода.
Якщо з якої-небудь причини яйце з жовтком не може потрапити в воронку або розвивається яйце повертається назад по яйцепроводу, речовини яйця потрапляють в порожнину тіла. У кращому випадку це означає, що яйце ніколи не буде відкладено, і самка може бути безплідною. У гіршому - білок яйця може викликати запальну реакцію, відому як «яєчний перитоніт», який може привести до загибелі птиці.
Якщо жовток успішно проходить вниз по яйцепроводу до матки, то на цьому шляху відбувається завершення утворення білкової оболонки, двох тонких подськорлупової оболонок і, нарешті, просоченої кальцієм шкаралупи. Тут же відбувається й запліднення піднімаються по яйцепроводу спермиями. Яйце залишається в піхву до тих пір, поки самка не буде готова відкласти його. У великих папуг подорож яйця від яєчника до гнізда займає від 36 до 56 годин.
У деяких самок папуг прагнення до розмноження дуже велике. Якщо птах вважає, що знаходиться в стабільних взаєминах з іншою птицею, зі своїм господарем або навіть з іграшкою, вона може почати відкладати яйця.
Самки таких видів, як нерозлучники, Кореллі і хвилясті папужки, досить часто починають відкладати численні кладки яєць, які призводять до надзвичайного виснаження їх організмів або до значного збільшення ризику «яєчно-жовткового перитоніту».
У інших попугаеобразних тривала стимуляція яєчника призводить до ослаблення м'язів стінки тіла і розвитку грижі у птиці. Методи виправлення поведінки і правильна дієта допомагають таким птахам, але іноді в подібних випадках доводиться хірургічно видаляти яєчник для того, щоб зупинити репродуктивну систему.
Чоловічі статеві органи складаються з двох сім'яників з придатками і сім'явивідних проток. Насінники є місцем утворення сперміїв. На відміну від ссавців, вони розташовуються усередині черевної порожнини. Під дією статевих гормонів в період спарювання насінники збільшуються в п'ять разів у порівнянні з їх первісної величиною. З придатків сім'яників і сім'явиносних проток спермии надходять в клоаку. Додаткові статеві залози, такі як, наприклад, передміхурова залоза, а також видимі наружние статеві органи у птахів відсутні. У нижній частині клоаки знаходиться копулятивний орган, але у більшості видів птахів він настільки малий, що його неможливо побачити неозброєним оком.