Класифікація вірусів складна і в даний час залишається незавершеною. Класифікаційні принципи К. Ліннея по відношенню до вірусів виявилися неприйнятними. З 1971 р у всьому світі офіційно використовуваної є Універсальна система класифікації вірусів, заснована на політетіческом ієрархічному принципі, висунутому М. Адансон (1727-1806 рр.) - французьким ботаніком, одним з основоположників природної системи рослин і застосування математичних методів в біології. За цим принципом враховується максимальне число морфологічних, фізіологічних, генетичних та інших ознак вірусів (не менше 60), кожен з яких має певну ступінь значущості. Недоліком адансоновой класифікації є не її трудомісткість, а відсутність повної інформації про багатьох віруси.
Порядки вірусів - це групи сімейств вірусів із загальними характеристиками, що відрізняються від інших порядків і сімейств. Позначаються назвами з суфіксами -virales. В даний час виділено 3 порядку вірусів: Mononegavirales (віруси, що містять однониткові негативні РНК), Caudovirales ( "хвостаті" бактеріофаги), Nidovirales (від лат. Nido - гніздо; віруси, у яких субгеномний РНК-сплайсинг транскрибується під час реплікації в формі гнізда ), з яких затвердженим МКТВ є тільки перший.
Порядок Mononegavirales включає сімейства: Paramyxoviridae, Rhabdoviridae і Filoviridae.
Сімейства вірусів - це групи пологів вірусів із загальними характеристиками, що відрізняються від вірусів інших сімейств. Позначаються назвою з суфіксом -viridae. Сімейство - термін, який витримав перевірку часом і не змінюється. Цей рівень таксономической ієрархії є стабільним наріжним каменем. Багато сімейства вірусів мають чітку відмінність будови віріона, структуру геному, і спосіб реплікації, що визначають филогенетическую незалежність або велику филогенетическую окрему структуру.
Підродини виділені в 4 родинах: Poxviridae, Herpesviridae, Parvoviridae, Paramyxoviridae - для більш складної ієрархії таксона. Позначаються суфіксом -virinae.
Критерії, що використовуються для опису сімейства вірусів відповідно до системи класифікації М. Адансон (взяті з вказівок МКТВ для опису сімейств):
Властивості віріона. 1. Морфологія віріона (розмір, форма, наявність або відсутність суперкапсиду і пепломеров, симетрія і структура капсида). 2. Фізичні властивості віріона (молекулярна маса, щільність, коефіцієнт седиментації, рН-стабільність, температурна стійкість, катионная (магній і марганець) стабільність, стійкість до розчинників, детергентів і дії променевої енергії). 3. Властивості генома (тип нуклеїнової кислоти, кількість ниток, лінійний або циркулярний, полярність, кількість сегментів, розмір генома або його сегментів, наявність або відсутність кепа на 5-кінці, наявність або відсутність на 5-кінці ковалентно зв'язаного поліпептиду, наявність або відсутність на 3-кінці полі (А) послідовності або іншою специфічною послідовності, послідовність нуклеотидів). 4. Властивості білків (кількість, розміри, функціональна активність, послідовність амінокислот). 5. Ліпіди (наявність або відсутність, природа). 6. карбогідратів (присутність або відсутність, природа).
Організація геному і реплікація. 1. Організація генома. 2. Спосіб реплікації нуклеїнових кислот. 3. Характеристики транскрипції. 4. Характеристики трансляції та посттрансляційних процесингу. 5. Місце акумуляції білків віріона, місце складання, місце вивільнення. 6. цитопатології.
Антигенні властивості. 1. Серологічні особливості. 2. Епітопи.
Біологічні властивості. 1. Коло господарів, природних і експериментальних. 2. Патогенність, зв'язок із захворюваннями. 3. Тканинної тропізм, патологія, ГИСТОПАТОЛОГИЯ. 4. Шляхи передачі в природі. 5. Векторні взаємини. 6. Географічна поширеність.
Роду вірусів - групи видів з загальними характеристиками, що відрізняються від вірусів інших родів. Позначаються термінами з суфіксом -virus. Цей ієрархічний рівень також є стабільним. Критерії для створення пологів розрізняються в різних сімействах: використовуються всі менші генетичні, структурні та інші особливості для створення нових пологів. Основою є загальне іншої природи походження (як і для родин), але це не постулат для майбутнього.
МКТВ розробляє специфічні властивості для визначення видів в Таксоні. Очевидно, що термін «вид» повинен визначатися чимось походимо на термін «вірус» - хоча в деяких випадках термін «вірус» краще поєднується з підвидом, штамом або навіть варіантом. Оскільки «вірус» визначається по-різному в різних родинах, види також повинні визначатися по-різному, в деяких випадках з акцентом на властивості геному, в інших - на структурних, фізико-хімічних або серологічних властивості. Деякі віруси і визначаються як види: поліовірус I, вірус хвороби Ньюкасла. Ці приклади, однак, не відображають труднощі при вирішенні, чи слід вважати вірус видом, підвидом, штамом або варіантом.
Номенклатура вірусів, згідно Універсальної системі класифікації вірусів, визначається наступними правилами: 1) закінчення в міжнародному назві виду вірусу має бути «... virus», роду - «... virus», підродини - «... virinae», сімейства - «... viridae», порядку - «... virales»; 2) порядок, сімейство, підродина, рід і вид повинні бути надруковані курсивом (або підкреслені) з великої літери; 3) видовому назвою вірусу повинні передувати назви порядку, сімейства, підродини і роду; 4) назви вірусів не скорочуються.
Приклади назви видів:
1. Порядок Mononegavirales. сімейство Rhabdoviridae. рід Lyssavirus. вид Rhabdovirus.
2. Сімейство Herpesviridae. підродина Alphaherpesvirinae. рід Simplexvirus. вид - простого герпесу вірус 2.
Класифікація вірусів, патогенних для людини, представлена в табл. 1.
Класифікація вірусів, патогенних для людини