Уейн Руні став найдорожчим тінейджером в світі, коли він підписав контракт з "Манчестер Юнайтед", який, в кінцевому рахунку, може коштувати клубу 30 мільйонів фунтів.
Трьох голів Уейна в чотирьох іграх проти Швейцарії та Хорватії, включаючи приголомшливий удар з 25 ярдів в матчі проти хорватів, було досить, щоб переконати сера Алекса Фергюсона в тому, що він повинен підписати контракт з нападаючим, за яким він стежив, коли тому було ще 14 років.
Після інтенсивних переговорів про трансфер гравця з "Евертоном", "Манчестер Юнайтед" нарешті зумів роздобути його в свої ряди до очевидною радості боса "червоних дияволів".
Уейн став також «Гравцем Матчу» в цій зустрічі, а в кінці року PFA вдруге поспіль назвала Руні «Кращим молодим футболістом Року», що стало повторенням рекорду його нинішнього одноклубника Райана Гіггза. Гра Уейна в минулому сезоні не залишилася непоміченою і уболівальниками клубу, які визнали гравця з 8-м номером на футболці володарем "Призу сера Метта Басбі», який вручається найкращому футболістові «МЮ» за підсумками року.
В останній день першості Англії в грі з «Челсі» Руні отримав травму, яка поставила під загрозу перспективи його участі на першості світу в Німеччині. Але завдяки відмінній роботі медиків і власним настрою, футболіст все ж зміг поїхати на головний футбольний турнір планети, але було ясно, що він до нього готовий не повністю. Апофеозом, в цілому блідої гри англійців на турнірі стала червона картка, отримана Руні в чвертьфінальному матчі зі збірною Португалії.
Важливо також відзначити, що Руні перервав, нарешті, свою довгу безгольову серію в Європі, де він не забивав, починаючи з гри проти «Фенербахче», провівши гол у ворота «Роми» у виїзному матчі в Римі. Потім він забив і в наступних двох європейських матчах клубу, включаючи м'яч, забитий на останній хвилині домашнього матчу з «Міланом», який приніс манкуніанцям перемогу з рахунком 3-2.
Надалі Уейн не зменшував обертів і відзначився своїм першим хет-триком у складі клубу в ворота «Портсмута» і «покером» в матчі з «Халлом», забивши всі голи своєї команди в цьому матчі. Не дивлячись на те, що за підсумками сезону в коміпілке трофеїв «Манчестер Юнайтед» виявився лише Кубок Ліги, сезон для 24-річного нападника в особистому плані вийшов по-справжньому феноменальним.
Він провів у складі «червоних дияволів» 42 матчі, забивши в них 34 голи. Лише травма, отримана в матчі Ліги Чемпіонів c «Баварією». не дозволила Руні завершити сезон на мажорній ноті. І, тим не менше за підсумками сезону, він по праву зібрав значну колекцію особистих нагород, ставши кращим гравцем року за версією PFA, футбольних журналістів, і Прем'єр Ліги.