У книзі "Основи наукового атеїзму" розглянуті науковий метод пізнання і численні докази атеїзму. Спростовано креаціонізм, доведено, що теорія еволюції відповідає другому закону термодинаміки. Представлені теорія еволюції Дарвіна, теорія великого вибуху, введення в наукову світську етику і науковий підхід у політиці та економіці і багато іншого. Запропоновано варіант виходу з кризи.
У книзі детально викладено науковий метод пізнання, застосовуваний вченими при наукових дослідженнях. Розглянуто критерій Поппера, принцип достатньої підстави Аристотеля, бритва Оккама, збір експериментальних даних і їх математико-статистична обробка, основи математичної логіки.
У книзі на прикладах доведено, що релігія не потрібна для моралі людей і що мораль може існувати без релігії. У книзі продемонстрована аморальність Біблії, яка схвалює садизм-мазохізм, геноцид, людські жертвоприношення. Показана непридатність християнської моралі для життя. Представлена наукова еволюційна світська етика: розум, інстинкти, виживання і розмноження роду. У книзі представлено науковий погляд на етику і мораль.