Г.І. Прохватілов народився в Михайлівці, Волгоградської області. У 1968 році вступив на стоматологічний факультет Московського медичного стоматологічного інституту, який успішно закінчив в 1973 р Під час навчання проявив інтерес до дослідницької роботи, активно займався в студентському науковому гуртку. Після закінчення інституту був покликаний в Збройні Сили СРСР, де в ході служби досяг посади начальника стоматологічного відділення військового госпіталю. У 1981 р він прийшов у Військово-медичну академію, де пройшов шлях від старшого ординатора, викладача, старшого викладача до заступника начальника кафедри щелепно-лицевої хірургії і стоматології.
Г.І. Прохватілов - один з перших щелепно-лицьових хірургів в нашій країні, який став займатися мікрохірургією. Ним розроблені фундаментальні теоретичні положення в пластичної хірургії, зокрема такий розділ, як сучасний хірургічний етап пластики і нові методи мікрохірургії (оптичне збільшення, мікрохірургічна техніка і мікросудинна аутотрансплантация тканин), класифікація методів шкірної пластики і комбінованої пластики. Всі вони мають важливе науково-практичне значення і забезпечують подальший розвиток даного напрямку.
Зазначені розробки Г.І. Прохватилова забезпечували виконання органозберігаючих операцій і відновлення функцій в повному обсязі. Цьому сприяли і запропоновані ним мікрохірургічні операції на магістральних судинах, особовому нерві і вивідних протоках великих слинних залоз.
У 1988-1989 рр. Г.І. Прохватілов перебував у службовому відрядженні в Республіці Афганістан, будучи головним стоматологом 40-ї армії. Досвід, набутий при наданні допомоги щелепно-лицьовим пораненим, дозволив йому із застосуванням клініко-функціональних, електрофізіологічних і гістологічних методів обгрунтувати первинну і ранню шкірну пластику вогнепальних дефектів м'яких тканин щелепно-лицевої ділянки у поранених на етапі спеціалізованої медичної допомоги в період локальних військових конфліктів.
За виконання інтернаціонального обов'язку в Афганістані та надання спеціалізованої хірургічної допомоги щелепно-лицьовим пораненим в Чечні полковник медичної служби, професор Г.І. Прохватілов був нагороджений високими урядовими нагородами: орденом «За службу Батьківщині в ЗС СРСР» III ступеня, орденом «За військові заслуги», а також орденом «Червоної Зірки» і багатьма медалями Республіки Афганістан.
Під безпосереднім керівництвом Г.І. Прохватилова колектив керований ним кафедри розробив спільно з конструкторами ТОВ «Науково-виробничого об'єднання« Полюс »(Воронеж) Польовий рухомий стоматологічний комплекс (ППСК) і польові стоматологічні укладання для Збройних сил Росії.
Геннадій Іванович відрізнявся широким кругозором, працездатністю, чарівністю, жвавістю і гостротою розуму. Він був високоерудованою фахівцем, знавцем літератури і театру.
Таким він і залишиться в пам'яті своїх товаришів по службі, учнів і всіх, хто знав його людей.
Стоматологічна асоціація Росії, ФГБВОУ ВПО Військово-медична академія ім. С.М. Кірова МО РФ, Кафедра щелепно-лицевої хірургії ФГБВОУ ВПО Військово-медичної академії ім. С.М. Кірова МО РФ, ФГБУ ЦНДІЗ і ЧЛХ, Редколегія журналу «Стоматологія»